经济部加工出口区管理处是中华民国加工出口区的主管机关，隶属于经济部。
    历史

    1950年代，政府陆续公布施行《外国投资人条例》、《华侨回国投资条例》及《奖励投资条例》。
    1966年12月3日设立高雄加工出口区，并成立加工出口区管理处。
    1969年设立台中加工出口区。
    1970年设立楠梓加工出口区。
    1997年12月设置港口型仓储转运专区，于台中港设置中港加工出口区。
    1999年2月5日经济部工业局委托中华工程公司兴建的高雄临海工业广场由加工区管理处接管，8月22日更名为临广加工出口区。
    2000年12月于屏东县头前溪六块厝农场设置屏东加工出口区；同月高雄软件科技园区动土。
    2013年元旦经济部改组为经济及能源部后，将整合经济部工业局部分业务改组为“产业园区管理局”。
    组织

    处长
    副处长
    主任秘书
    行政部门

    第一组
    第二组
    第三组
    第四组一 
    秘书室
    人事室
    会计室
    政风室
    所属园区台中分处（潭子园区）
    中港分处（中港园区）
    高雄分处（高雄园区、临广园区、成功物流园区、代管高雄软件科技园区、高雄航空货运园区）
    屏东分处（屏东园区）
    加工出口区楠梓园区（直属管理处）
    未来组织

    经济及能源部产业园区管理局
    局长
    副局长
    主任秘书
    地区分局