1949年前中国没有专门从事煤炭科学研究的机构，1949年后，随着煤炭工业的发展，煤炭科学研究机构逐步建立和发展。50年代初首先建立抚顺煤炭科学研究所，1956年改称院，同年建立唐山煤炭科学研究院。1957年建立北京煤炭科学研究院，嗣后改称煤炭工业部煤炭科学研究院，逐步发展成为中国煤炭科学技术的研究中心，首任院长王德滋，设有13个专业研究所（或分院），一个电子计算机中心，一个科研试制中心。煤炭科学研究院本部在北京，设有开采、建井、煤化学、经济四个研究所和一个电子计算机中心。其他各分院、所设于全国各地，分别从事一个或数个专业的研究。抚顺煤研所主要从事煤矿安全及露天开采研究；唐山煤炭科学研究分院主要从事煤炭洗选加工，水力采煤，管道运输，铁道下、水体下、建筑物下采煤研究；太原煤研所主要进行采掘机械研究；西安煤田地质勘探科学研究分院从事煤田地质勘探技术研究；重庆煤研所主要从事煤矿安全研究；上海煤研所从事煤矿采掘机械及电器研究；南京研究所、常州自动化研究所和淮北爆破技术研究所分别从事矿井井筒开凿工艺及设备、煤矿自动化技术、爆破器材和技术的研究；常州科研试制中心从事科研测试设备及科研新产品制造。二十多年来，煤炭科学研究院与有关单位合作，取得600多项研究成果,其中1978年全国科学大会上获奖的有110项。煤炭科学研究院及所属各分院、所出版的学术刊物有《煤炭科学技术》、《建井技术》、《煤矿机械化与电器》、《选煤技术》、《煤矿安全》、《煤田地质勘探》、《煤矿自动化》等11种。

中国煤炭科学研究机构，除煤炭科学研究院系统外，还有省（自治区）属煤研所20个，厂属研究所69个。矿业学院还设有研究机构。